Mascot daemon

Mascot daemon官方版是一款可以帮助用户进行蛋白质鉴定的软件。Mascot daemon最新版   通过特有的基于随机匹配概率的打分方法，支持标准统计显著性检验分析。Mascot daemon官方版可检索各种类型数据库，包括序列库和谱图库;智能、自动化的数据库管理模块, 灵活的私人数据库建立方式。

Mascot daemon基本简介

      Mascot软件是一款专业实用的蛋白质鉴定软件，Mascot软件主要利用肽段序列数据检索的方法来鉴定样本中蛋白质的组成以及翻译后修饰的行业标准软件，mascot软件的本地客户端工具安装包，能够方便的提交质谱搜库到SERVER服务器操作。

Mascot daemon功能介绍

      Mascot软件通过一个整合的软件包，支持目前主流的三种检索算法;

      通过特有的基于随机匹配概率的打分方法，支持标准统计显著性检验分析;

      针对大数据集检索的特点，整合FDR阈值选项及Percolator大规模数据检索质量控制算法，大大提高大规模数据检索的结果质量;

      可检索各种类型数据库，包括序列库和谱图库;智能、自动化的数据库管理模块, 灵活的私人数据库建立方式;

      可以自动建立检索目录，自动扫描数据库目录中已有的库文件识别其格式，无需指定酶的特异性，对于特异性的化学修饰或翻译后修饰的鉴定都非常灵活;

      支持几乎所有常用的质谱仪输出的数据格式。通过高效率的代码可满足从单线程到多线程系统或集群的高通量计算需求;

      Mascot软件支持所有的Web浏览器，给出概述性和详细的结果报告，可自定义蛋白检索报告形式，并且配以详尽的在线帮助文档帮助用户理解分析结果;

      已有数千个学术及商业用户，被Frost & Sullivan形容为“质谱数据检索的黄金标准”;

Mascot daemon软件特色

      1.批量提交搜库任务：可以同时递交一系列的搜库文件进行同时、队列或者定时的搜库

      2.时监控任务进程：当任务传递以后，能够实时对搜库进度进行监控

      3.灵活的队列任务：能够对同一质谱文件进行多参数的多轮队列搜库

      4.可以通过命令行直接向Mascot Server递交任务，避开IIS构架上运行Mascot对上传文件大小4GB的限制

      5.和Distiller联用可以批量进行所有类型的质谱原始文件搜库

      6.加入导出和导入工作任务数据库的功能，不需担心在软件升级后，原有的工作任务列表丢失

      7.在Windows操作系统中，Mascot提供了一个批量上传搜库任务的桌面客户端，能够保存各类搜库参数和工作任务

Mascot daemon使用说明

      1.打开软件之后，进入软件界面

      2.根据提示，在Intranet界面分别填写您的服务器名称、access type(访问类型)、proxy server(代理服务器)等等

      3.在data import filters(数据导入过滤器)选择导入过滤器缓存的文件的根文件夹、保存路径、AB SCUEX MS 数据转换器路径、ProteoWizard ms装换路径

      4.在开放数据库连接界面，选择Engine(引擎)、Driver(驱动程序)Path(路径)

      5.在Timer settings(定时器)界面，设置timer tick interval(定时器间隔)、delay after opening empty dataset(延迟开放后空的数据集)、file size wust be constant for at least(文件大小必须至少保持不变)等

      6.在authentication(身份验证)界面，设置web server authentication(web服务器身份验证)、proxy server authentication(代理服务器认证)、mascot security(mascot 的安全)

      7.以上内容设置完毕，点击“Save”按钮，您界可以进行操作了

Mascot daemon安装步骤

      1.在pc下载网下载Mascot daemon最新版软件包

      2.解压Mascot daemon软件，运行文件

      3.双击打开,进入Mascot daemon软件界面，点击下一步

      4. 请仔细阅读下面的安装许可协议，是否接受上述许可证协议的所有条款，点击我同意，点击下一步

      5.选择目的地位置，软件将被安装到以下列出的文件夹中，要选择不同位置，建入新的路径，点击下一步

      6.选择一个附加任务，选择在安装软件时运行的附加任务，然后单击下一步

      7.安装程序现在准备开始安装软件到您的电脑上，单击安装继续此安装程序

      8.点击完成，Mascot daemon软件安装成功

      1.对部分功能进行了优化

      2.解了好多不能忍的bug