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OVITO

OVITO最新版 3.4.4

OVITO段首LOGO

软件大小:63.53MB

软件语言:简体中文

软件授权:免费版

软件类别:教育教学

软件等级:

更新时间:2023-03-18

下载次数:0

应用平台:WinAll

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OVITO最新版是一款适用于科学实验者使用的分子动力学模拟工具。OVITO最新版让用户可以轻松进行各种分子动力的模拟,为研究分子之间的运动提供了帮助。OVITO最新版非常适合需要研究分子动力学的用户,满足用户的各种分子运动研究需求。

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OVITO软件特色

      丰富的内置函数。丰富的内置函数使其具有强大的分析功能。

      消耗内存小。相对于VESTA,VMD等软件,消耗内存小。导入大体系运行流畅。

      正则表达式。正则表达式功能使得OVITO对结构的操作灵活自由。

OVITO使用教程

      【如何利用 OVITO 做类似 NC 文章中的位错环分析】

      由于本人重复 NC 文章级联碰撞过程使用的体系很小,所以根本形成不了位错环,因此很干脆的在 Fe 当中手动的建了一个位错环,这里再给各位安利一个建模软件,Atomsk,一款金属材料界建模利器(多晶,晶界,位错以及界面等等),有兴趣的同学可以百度一下,以下是用 OVITO 展示了我用 Atomsk 建的一个 Fe 的位错环(导入坐标文件后直接在 Add modification 中选取 Dislocation analysis(DXA)即可):

      可以看到 OVITO 不仅帮忙找出了位错环,而且还能帮忙指出了几个位错环,各个位错环的长度以及其伯格斯矢量(对应 NC 文章的 fig.3)。

      【如何利用 OVITO找弗伦克尔缺陷】

      利用 OVITO 找弗伦克尔缺陷对需要准备两个文件:一个是结构演化前的坐标文件,一个是结构演化过程的坐标文件(这个是利用 LAMMPS 的 dump 命令进行输出)。以我上次最后给出的演化示意图的制作为例,一共用到了 OVITO 的十个功能,我在下方图中标了出来。具体操作过程如下:

      将演化过程的文件导入 OVITO 软件后,选取下图2中标注 1 处(Filecontains time series),告诉 OVITO 该文件是个演化过程文件,随后选择下图中标注 2 处(Add modification),这里面几乎包含了 OVITO 软件的所有功能,有兴趣的同学可以去探索一下。在图2 中标注 2 处里面找到并选取 Wigner - Seitz defect analysis (这也是 NC 文章中所提到的缺陷分析方法);

      接着点击下图 标注 5 处导入演化前的结构文件。然后会在图3 中标注 6 处发现软件告诉你找到几个空位和几个间隙子(一般情况下这两个值是相等的),继续点击图3 中标注 7 处(播放键),OVITO 便会自动统计演化过程中每个时刻产生的空位数目和间隙子数目。

      但是,NC 文章中的演化图中只有空位和间隙子,并不是 Fe 原子 ~,继续选取 Add modification 处,找到里面的 Expression select(图4 中标注 8 处),选取后 OVITO 会给你一个方框,在里面填写 Occupancy==1 (这是告诉 OVITO 让它将没有离开晶格位置的 Fe 原子都选中),然后在 2 处选择 Delete selected particles(图中标注 9 处),让 OVITO 将这些 Fe 原子都删掉,这样就只剩下空位和间隙子了,接着再次重复一下 Expression select 这个过程,选取 Occupancy == 2 或者 0 (这是告诉 OVITO 让它将间隙子或者空位都选中),然后在 Add modification 中找到 Assign color(图4中标注 10 处),给选中的空位或者间隙子赋予自己喜欢的颜色,随后再次点击播放键,OVITO 将为你展示完整的缺陷演化过程。至于图2 中标注 3,4 这两个地方,一个是输出演化过程视频文件,一个是输出单张图片。

OVITO更新日志

1:全新界面,清爽,简单,高效

2:性能越来越好

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OVITO与dwi4vcz4等都是非常不错的软件,欢迎来我站下载体验!

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