Geneious

Geneious官方版

Geneious为所有分子的生物学家和的生物化学家而设计，分析复杂生物资料使用简便的一个应用软件。Geneious功能强劲，可以用于分析和处理生物信息学数据，支持序列对比和系统学分析、毗连群、引物设计和克隆和限制性分析等。PC下载网提供Geneious软件的下载服务，欢迎大家前来下载使用!

Geneious主要功能

      1、NGS分析和基因组学

      使用行业领先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析，包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。

      2、序列图和色谱分析

      修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件，正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。

      3、对齐和树构建

      使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和突出显示。使用包括RAxML和PAUP在内的同行评审算法构建系统树，并为公开准备的图形调整显示设置。

      4、分子克隆

      查看质粒图，自动注释矢量并用注释复制粘贴序列。寻找限制站点、消化、连接和执行Golden Gate，Gibson和Gateway克隆。设计引物，找到CRISPR站点并优化密码。在克隆过程中跟踪历史和亲子后代谱系。

      5、搜索、共享和自动化

      针对NCBI进行批量BLAST，并直接搜索GenBank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程，以提高效率，控制业务流程，并减少您的研究中的人为错误。

      6、SnapGene文件导出

      将SnapGene*.dna序列文件拖放到Geneious中，无缝地导入序列及其注释和其他元数据。

      7、CRISPR-CPF1特异性评分

      自信地选择最佳CRISPR-CPF1引导RNA位点使用新的特异性评分，这是根据对您选择的数据库的非目标分析计算出来的。

      8、智能NGS导入

      只需一个简单的步骤就可以将任何类型的SAM、BAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中，即使您有不同的样品和参考序列的混合物。

      9、CRISPR Cpf1选项

      添加了CRISPR-CPF1与5’PAM位点的支持。在A和T丰富序列中找到位点，并在体内具有更高的裂解效率。

      10、RNA-Seq表达分析的火山图

      在交互式火山图中可视化基因表达，可以用来突出和跳转到差异表达基因。

      11、限制性位点无表型突变分析

      自动识别在不影响蛋白质的情况下引入限制位点的编码序列中的点突变。

      12、漂亮的PCA图

      具有更好的标签和新的可视化选项，创建漂亮的PCA图形。

      13、创建酶制剂

      不再从其他来源获取信息。现在您可以很容易地创建您自己的酶组。

      14、更好的FASTQ导入功能

      在导入过程中，成对读取可以相互关联，而Geneious会猜出它们是如何配对的。还可以设置读取技术。

      15、为细菌基因组比对更新Mauve插件

      现在包括对序列列表的支持和用于重新排序重叠群的MCM操作，使draft基因组对齐和进行基因组整理成为可能。

      16、更好的BLAST服务器管理

      一次设置多个BLAST服务器镜像，每次搜索时，选择最好的一个。不用每次切换镜像。

      17、NCBI BLAST云支持

      有了NCBI BLAST云之后，设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像，Geneious可以与它连接起来。

      18、按索引连接

      连接序列列表并按索引对齐，而不是按照名称对齐，这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。

      19、序列列表的CSV/TSV导出

      将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV或TSV中，这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步分析。

Geneious安装方法

      1、在本站下载Geneious软件包，解压缩后双击“Geneious_win64_10_2_2_with_jre.msi”程序进入欢迎安装界面，点击Next继续

      2、查看软件许可协议，勾选我同意协议内容，然后点击Next继续

      3、软件默认安装位置为“C:Program FilesGeneious”，点击Change...可以选择其它位置安装

      4、根据需要选择需要安装的组件，建议默认全部勾选，点击Next继续

      5、选择在桌面创建快捷方式，然后点击Next

      6、软件安装准备完毕，点击Install开始安装

      7、软件正在安装中，请等待

      8、软件安装成功，点击Finish退出安装向导

Geneious常见问题

      如何卸载Geneious软件?

      方法一：打开电脑控制面板>>程序>>程序和功能，在程序和功能面板中找到Geneious软件，右键点击卸载即可

      方法二：安装并打开电脑管家软件，选择进入软件管理选项，点击卸载选项，在列表中找到Geneious软件，点击卸载即可

      方法三：安装并打开360软件管家，在卸载选项的列表中找到Geneious软件，点击卸载即可

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      1.修复部分bug

      2.优化了部分功能